MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycobacterium smegmatis JS623

Total Repeats: 12562

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_019966	GCC	2	6	6414501	6414506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12502	NC_019966	GCA	2	6	6415574	6415579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12503	NC_019966	TCGC	2	8	6415589	6415596	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12504	NC_019966	CAC	2	6	6415606	6415611	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12505	NC_019966	CCCTCG	2	12	6415652	6415663	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
12506	NC_019966	TGCT	2	8	6415776	6415783	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12507	NC_019966	CGGC	2	8	6415803	6415810	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12508	NC_019966	AGCGC	2	10	6415811	6415820	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
12509	NC_019966	CCAA	2	8	6415878	6415885	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12510	NC_019966	GGCAT	2	10	6415925	6415934	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
12511	NC_019966	GCA	3	9	6415980	6415988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12512	NC_019966	TGC	2	6	6415990	6415995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12513	NC_019966	ACAT	2	8	6417422	6417429	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12514	NC_019966	CGAC	2	8	6417462	6417469	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12515	NC_019966	GGC	2	6	6417529	6417534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12516	NC_019966	CTTT	2	8	6417628	6417635	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12517	NC_019966	GTGTT	2	10	6417729	6417738	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
12518	NC_019966	GTTG	2	8	6418646	6418653	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12519	NC_019966	TCC	2	6	6419171	6419176	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12520	NC_019966	CCT	2	6	6419561	6419566	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12521	NC_019966	AGG	2	6	6419598	6419603	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12522	NC_019966	GC	3	6	6420777	6420782	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12523	NC_019966	CGG	2	6	6420825	6420830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12524	NC_019966	CA	3	6	6420948	6420953	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12525	NC_019966	CG	3	6	6421318	6421323	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12526	NC_019966	CGG	2	6	6421386	6421391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12527	NC_019966	GCC	2	6	6425944	6425949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12528	NC_019966	CGC	2	6	6425962	6425967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12529	NC_019966	CGA	2	6	6425981	6425986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12530	NC_019966	ATC	2	6	6426021	6426026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12531	NC_019966	GGC	2	6	6426927	6426932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12532	NC_019966	AT	3	6	6426935	6426940	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12533	NC_019966	CGT	2	6	6426972	6426977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12534	NC_019966	GTC	2	6	6427601	6427606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12535	NC_019966	AACG	2	8	6429651	6429658	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12536	NC_019966	ACC	2	6	6429678	6429683	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12537	NC_019966	CGTG	2	8	6429724	6429731	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12538	NC_019966	CGA	2	6	6429749	6429754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12539	NC_019966	ACTGA	2	10	6430586	6430595	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
12540	NC_019966	CGG	2	6	6430613	6430618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12541	NC_019966	CG	3	6	6433879	6433884	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12542	NC_019966	GCT	2	6	6434533	6434538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12543	NC_019966	AAG	2	6	6434670	6434675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12544	NC_019966	AAT	2	6	6436025	6436030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12545	NC_019966	CG	3	6	6438200	6438205	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12546	NC_019966	TGG	2	6	6441159	6441164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12547	NC_019966	CCG	2	6	6441236	6441241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12548	NC_019966	CGG	2	6	6442182	6442187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12549	NC_019966	GCC	2	6	6442577	6442582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12550	NC_019966	CAT	2	6	6443203	6443208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12551	NC_019966	GTG	2	6	6443226	6443231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12552	NC_019966	CCG	2	6	6443247	6443252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12553	NC_019966	CGCA	2	8	6445397	6445404	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12554	NC_019966	CGG	2	6	6454402	6454407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12555	NC_019966	ACCT	2	8	6454446	6454453	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
12556	NC_019966	CGG	2	6	6455111	6455116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12557	NC_019966	CGC	2	6	6457243	6457248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12558	NC_019966	TGC	2	6	6457308	6457313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12559	NC_019966	TGC	2	6	6459390	6459395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12560	NC_019966	TTCA	2	8	6459443	6459450	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12561	NC_019966	TCC	2	6	6462317	6462322	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12562	NC_019966	TTG	2	6	6464899	6464904	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.